1682年彼得一世登基时，俄国已经成为一个横跨欧亚大陆、领土面积居世界第一的大帝国，但除了广袤的国土，18世纪初的俄国在各方面却远远落后于当时的西欧国家。

面对俄罗斯和西欧的差距，彼得一世以强硬的手段推行了一场社会变革。俄罗斯皇家科学院的前身彼得堡科学院，正是在这种背景下由彼得一世的倡议之下创建，与彼得一世的改革活动直接相关。在18世纪初的25年期间，彼得一世在工业、农业、商业、国家管理与文化方面进行了巨大的改革，建立科学院是彼得一世教育改革的顶峰。

在19世纪上半叶拿破仑战役结束后，俄罗斯皇家科学院的工作逐步走入正轨。俄国废除了农奴制度，国家进入资本主义时代，俄国科学也进入快速发展时期。19世纪60-90年代，科学活动快速增长，学者积极性高涨，科学研究取得辉煌成绩，因此19世纪下半叶被称为“俄国自然科学的黄金时代”或“俄国科学的春天”。

在“二月革命”后，皇家科学院易名为“俄罗斯科学院”，仍然继续着过去的研究。但八月革命之后，由于大量的科学家参加了各种资历产阶级和小资产阶级的党派，不信任苏维埃政权，尽管乌米扬诺夫要求慎重对待科学院，在不经过严惩破坏的情况下将科学院成员永久性地纳入苏维埃国家建设的轨道。但随的几年中，因为契卡以及社工党的暴行，令大量的科学院院士、技术人员选择逃离苏联，与到陌生的国外相比，他们中更多的人选择前往位于西伯利亚的俄罗斯帝国，毕竟这里仍然是俄罗斯。

尽管当时俄罗斯帝国经济困难，但在安娜女摄政的要求下，阿列克谢沙皇仍然通过重建皇家科学院的决定，并将伊尔库茨克城郊的一处贵族庄园作为皇家科学院院址，即便是在战争时期皇家科学院仍然保持着正常的运行，而随着战争的结束、俄罗斯帝国经济的好转，使得俄罗斯有相对充足的资金用于科学研究。

一定程度上拥有一千六百余名院士的皇家科学院是俄罗斯帝国的科技大脑，由于俄罗斯国内企业无法提供经费支持技术研发，现在的皇家皇学院有一半的院系实际上充当的是企业的研发机构。这现在的皇家科学院与过去旧科学院经常存在的理论脱离实践有着明显的不同。

现在的皇家科学院在保持着重视理论的同时，受到商业发展的影响更加注重实践，将科学成果转变成生产力，毕竟科学院的经费除了政府财政预算拨款、俄罗斯基础研究的基
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